RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 PTPN18Q99952 460 aa17.89■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.89■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 TIMM10P62072 90 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 DIXDC1Q155Q3 683 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ERO1BQ86YB8 467 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 LAMB1P07942 1786 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 A0A1B0GUL7 405 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ADORA1P30542 326 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 TFCP2Q12800 502 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 SLF2Q8IX21 1173 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 WRNIP1Q96S55 665 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 CRHR2Q13324 411 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 RASGRF1Q13972 1273 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 BRI3BPQ8WY22 251 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 CLUAP1Q96AJ1 413 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 XAGE2Q96GT9 111 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ERO1AQ96HE7 468 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 USP40Q9NVE5 1235 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 GAKO14976 1311 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 CCL15Q16663 113 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 OTUD5Q96G74 571 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 IDI2Q9BXS1 227 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 TNNQ9UQP3 1299 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 CETPP11597 493 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 SP3Q02447 781 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 PPATQ06203 517 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 NFIAQ12857 509 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 PPIL2Q13356 520 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 TMEM57Q8N5G2 664 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 FAM198AQ9UFP1 575 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ENTPD3O75355 529 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 TCP10Q12799 353 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 SNAPC2Q13487 334 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 NEUROD6Q96NK8 337 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ABCF2Q9UG63 623 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 TRIM17Q9Y577 477 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 OTOFQ9HC10 1997 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 IRF6O14896 467 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 SOX10P56693 466 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ARHGEF6Q15052 776 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 GORABQ5T7V8 394 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 GPR108Q9NPR9 543 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 MYH13Q9UKX3 1938 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 POLA2Q14181 598 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 FAM43AQ8N2R8 423 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 SSH3Q8TE77 659 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 HMG20BQ9P0W2 317 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 LDHCP07864 332 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 MS4A1P11836 297 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 INPP5BP32019 993 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 RGS3P49796 1198 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ATP8B2P98198 1209 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 MAP3K10Q02779 954 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 SPATA5Q8NB90 893 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 EFCC1Q9HA90 598 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 TLR2O60603 784 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 GSTO1P78417 241 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 MECOMQ03112 1051 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ZFPM1Q8IX07 1006 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 RFX7Q2KHR2 1363 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 BTBD19C9JJ37 291 aa17.78■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 IGSF3O75054 1194 aa17.78■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 BTDP43251 543 aa17.78■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ATRNL1Q5VV63 1379 aa17.78■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 CXCL11O14625 94 aa17.77■□□□□ 0.44
TNS1-208ENST00000439083 ANKRD23Q86SG2 305 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms