RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa19.15■□□□□ 0.66
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 C17orf99Q6UX52 265 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
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