RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.97■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 AK9Q5TCS8 1911 aa22.97■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 GNRH1P01148 92 aa22.96■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 INPP5BP32019 993 aa22.96■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.96■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF16BQ96L93 1317 aa22.96■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRMT2P55345 433 aa22.95■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPATQ06203 517 aa22.95■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 CPA4Q9UI42 421 aa22.95■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 FGFR2P21802 821 aa22.94■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.94■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC5A1P13866 664 aa22.93■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 TCP10Q12799 353 aa22.93■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 C17orf99Q6UX52 265 aa22.93■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM151AQ8WW52 585 aa22.93■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPRCP08575 1304 aa22.92■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 H0YGN5 161 aa22.92■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDHXO00330 501 aa22.92■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 PSMC4P43686 418 aa22.92■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.92■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP44Q9H0E7 712 aa22.92■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 EYA2O00167 538 aa22.91■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.91■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 LPIN2Q92539 896 aa22.91■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM47Q96LD4 638 aa22.91■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 SRRDQ9UH36 339 aa22.91■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.91■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 CTGFP29279 349 aa22.9■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTFR1Q15390 333 aa22.9■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.9■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 RAET1EQ8TD07 263 aa22.9■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.9■■□□□ 1.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 OSBPP22059 807 aa22.89■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 HOXD10P28358 340 aa22.89■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 NFIAQ12857 509 aa22.89■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.89■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.88■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRDX5P30044 214 aa22.88■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRK4P32298 578 aa22.88■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 SHISA4Q96DD7 197 aa22.88■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 SZT2Q5T011 3432 aa22.88■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF521Q96K83 1311 aa22.87■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.87■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP40Q9NVE5 1235 aa22.87■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYPNQ86TC9 1320 aa22.86■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 MOGSQ13724 837 aa22.86■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.86■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 DPF3Q92784 378 aa22.86■■□□□ 1.25
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SIL1Q9H173 461 aa22.86■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.86■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP2B3Q16720 1220 aa22.85■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.85■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCL5P13501 91 aa22.84■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.84■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 CXCL11O14625 94 aa22.83■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP2C8P10632 490 aa22.83■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 FCGRTP55899 365 aa22.83■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.83■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 RNF208Q9H0X6 261 aa22.83■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.83■■□□□ 1.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 DOCK2Q92608 1830 aa22.82■■□□□ 1.24
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GJA8P48165 433 aa22.82■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBXN2AP68543 259 aa22.82■■□□□ 1.24
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.82■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 PICK1Q9NRD5 415 aa22.82■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.82■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 E9PSI1 815 aa22.81■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCRP11274 1271 aa22.81■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHKA1P46020 1223 aa22.81■■□□□ 1.24
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.81■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 CIAO1O76071 339 aa22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO3Q9UK99 471 aa22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.8■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.79■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.79■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 SEMA3EO15041 775 aa22.79■■□□□ 1.24
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