RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.6■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.6■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.59■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.59■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 METTL24Q5JXM2 366 aa18.59■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 ERO1BQ86YB8 467 aa18.59■□□□□ 0.57
CITED1-204ENST00000427412 CACNB3P54284 484 aa18.58■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.58■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.58■□□□□ 0.56
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CITED1-204ENST00000427412 WRNIP1Q96S55 665 aa18.58■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.58■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 TLR2O60603 784 aa18.57■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 CETPP11597 493 aa18.57■□□□□ 0.56
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CITED1-204ENST00000427412 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
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CITED1-204ENST00000427412 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.56■□□□□ 0.56
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CITED1-204ENST00000427412 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 BCAMP50895 628 aa18.55■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 SNAPC2Q13487 334 aa18.55■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 DCAF15Q66K64 600 aa18.55■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.55■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 SZT2Q5T011 3432 aa18.55■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.54■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 MEIS3Q99687 375 aa18.54■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.54■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 USP44Q9H0E7 712 aa18.54■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.54■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
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CITED1-204ENST00000427412 PRMT2P55345 433 aa18.53■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 PPATQ06203 517 aa18.53■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 PANK1Q8TE04 598 aa18.53■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.53■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 ADGRA2Q96PE1 1338 aa18.52■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CITED1-204ENST00000427412 KIF22Q14807 665 aa18.52■□□□□ 0.56
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CITED1-204ENST00000427412 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 C17orf99Q6UX52 265 aa18.51■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.51■□□□□ 0.55
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CITED1-204ENST00000427412 LPIN2Q92539 896 aa18.51■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.51■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.51■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 SLC5A1P13866 664 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 INPP5BP32019 993 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 ATRNL1Q5VV63 1379 aa18.5■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 ZBTB22O15209 634 aa18.49■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.49■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.49■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 CTGFP29279 349 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 PRDX5P30044 214 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 MOGSQ13724 837 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 MIGA2Q7L4E1 593 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 SHISA4Q96DD7 197 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 FBXO3Q9UK99 471 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 LOC285556D6RIA3 1793 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 GNAI3P08754 354 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 NFIAQ12857 509 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 TRIM47Q96LD4 638 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 SRRDQ9UH36 339 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 COG6Q9Y2V7 657 aa18.47■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 PDHXO00330 501 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 MS4A1P11836 297 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 CPA4Q9UI42 421 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-204ENST00000427412 ALPK3Q96L96 1907 aa18.45■□□□□ 0.54
CITED1-204ENST00000427412 CIAO1O76071 339 aa18.45■□□□□ 0.54
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