RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-208ENST00000420964 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
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FAAP20-208ENST00000420964 FLT1P17948 1338 aa14.66□□□□□ -0.06
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FAAP20-208ENST00000420964 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-208ENST00000420964 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-208ENST00000420964 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-208ENST00000420964 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-208ENST00000420964 NBPF3Q9H094 633 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-208ENST00000420964 RRAGCQ9HB90 399 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-208ENST00000420964 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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