RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 DPYDQ12882 1025 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 C21orf2O43822 256 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 POGKQ9P215 609 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 CASZ1Q86V15 1759 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 GPR162Q16538 588 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 ABCC11Q96J66 1382 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 C9orf172C9J069 976 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 DYRK3O43781 588 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 SEC13P55735 322 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 SYT17Q9BSW7 474 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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PTPRK-210ENST00000415055 GSX2Q9BZM3 304 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRK-210ENST00000415055 AKAP12Q02952 1782 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 CCINQ13939 588 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 SSH2Q76I76 1423 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 NUDT8Q8WV74 236 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRK-210ENST00000415055 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRK-210ENST00000415055 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRK-210ENST00000415055 PRMT3O60678 531 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 SELPP16109 830 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 MBTPS1Q14703 1052 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 PIK3C2GO75747 1445 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-210ENST00000415055 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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