RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 GGA1Q9UJY5 639 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 MSL1Q68DK7 614 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX11Q96FC9 970 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 LAMB1P07942 1786 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 GPT2Q8TD30 523 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 POLLQ9UGP5 575 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 SRGNP10124 158 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5-204ENST00000412806 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 PPARAQ07869 468 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 SP8Q8IXZ3 490 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 TMC4Q7Z404 712 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CD209Q9NNX6 404 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 USP48Q86UV5 1035 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT23Q9C075 422 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM4AO75164 1064 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 NPR1P16066 1061 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM87BQ96K49 555 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 PDE6BP35913 854 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 FERMT3Q86UX7 667 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 SENP2Q9HC62 589 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 SMIM22K7EJ46 135 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 IL1R1P14778 569 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC15A2Q16348 729 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 GRIK5Q16478 980 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 C6orf229H3BNL8 230 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 PPFIA3O75145 1194 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 LY9Q9HBG7 655 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 TOMM22Q9NS69 142 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-204ENST00000412806 IGSF3O75054 1194 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 CTR9Q6PD62 1173 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 OLFM4Q6UX06 510 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 MASTLQ96GX5 879 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 FSD2A1L4K1 749 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 H3BQV1 296 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDH1B1P30837 517 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 FOSBP53539 338 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 IFFO2Q5TF58 517 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 STK32BQ9NY57 414 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 FIBPO43427 364 aa25.31■■□□□ 1.64
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