RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.59■□□□□ 0.57
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MX1P20591 662 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NF2P35240 595 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FKBP1BP68106 108 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CST9Q5W186 159 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF384Q8TF68 577 aa18.58■□□□□ 0.56
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLIM4O00461 696 aa18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAG3O95817 575 aa18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCG2P16885 1265 aa18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTDP43251 543 aa18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASA3Q14644 834 aa18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.57■□□□□ 0.56
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP40Q9NVE5 1235 aa18.57■□□□□ 0.56
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.56■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IDI2Q9BXS1 227 aa18.56■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOOK2Q96ED9 719 aa18.55■□□□□ 0.56
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LNPKQ9C0E8 428 aa18.55■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.55■□□□□ 0.56
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENTPD3O75355 529 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP7A1P22680 504 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHBDL3P58872 404 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASSF10A6NK89 507 aa18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE1AP54750 535 aa18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM151AQ8WW52 585 aa18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE6AP16499 860 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLK2Q6UY11 383 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TICAM2Q86XR7 235 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNTNAP1P78357 1384 aa18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNCXA6NJT0 531 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE3CQ15386 1083 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.51■□□□□ 0.55
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEPSINQ96N21 525 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.51■□□□□ 0.55
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADD2P35612 726 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFIAQ12857 509 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K11Q16584 847 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARMC9Q7Z3E5 817 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS3P49796 1198 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VASPP50552 380 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HUNKP57058 714 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX11Q8IYF3 940 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ECE1P42892 770 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HTRA3P83110 453 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF15Q66K64 600 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EVI5LQ96CN4 794 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCP10Q12799 353 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.47■□□□□ 0.55
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