RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397062.7

NFE2L2-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L2, Length 2,853 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L2-201ENST00000397062 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CCDC175P0C221 793 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 MYL5Q02045 173 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 JMYQ8N9B5 988 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PTPDC1A2A3K4 754 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NDUFAB1O14561 156 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CHUKO15111 745 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ZEB2O60315 1214 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PDHBP11177 359 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 FNTAP49354 379 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NAA25Q14CX7 972 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 BPIFA3Q9BQP9 254 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CDK19Q9BWU1 502 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.86■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 KIAA0754O94854 1291 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ADALQ6DHV7 355 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 GBP3Q9H0R5 595 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CTAGE9A4FU28 777 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ENC1O14682 589 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CHST3Q7LGC8 479 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 MYBL2P10244 700 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ARMC3Q5W041 872 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 SCLT1Q96NL6 688 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa17.85■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NUTM2FA1L443 756 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CTDNEP1O95476 244 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CDC27P30260 824 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ATP1A2P50993 1020 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PDCLQ13371 301 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NUTM2GQ5VZR2 741 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ACRBPQ8NEB7 543 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 FSD1Q9BTV5 496 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 KLC4Q9NSK0 619 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 AGPSO00116 658 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PDE4BQ07343 736 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CAPZA3Q96KX2 299 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 ECHDC1Q9NTX5 307 aa17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PFKFB2O60825 505 aa17.83■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 SRGAP2O75044 1071 aa17.83■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 NEK1Q96PY6 1258 aa17.83■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.83■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
NFE2L2-201ENST00000397062 PFKFB1P16118 471 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 CEP85LQ5SZL2 805 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 AACSQ86V21 672 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 STK11IPQ8N1F8 1099 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 STAG1Q8WVM7 1258 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 ADGRG1Q9Y653 693 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 IKBKBO14920 756 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 AP1G2O75843 785 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 GCKP35557 465 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 GRIN2DO15399 1336 aa17.82■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 ZNF827Q17R98 1081 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 CDC25CP30307 473 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 DDR1Q08345 913 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 C11orf91Q3C1V1 193 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 KCTD16Q68DU8 428 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 TICAM2Q86XR7 235 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 SPTLC2O15270 562 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 CALRP27797 417 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 HDGFP51858 240 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 SNX1Q13596 522 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 COG1Q8WTW3 980 aa17.81■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 FOXN1O15353 648 aa17.8■□□□□ 0.44
NFE2L2-201ENST00000397062 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms