RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 BACH2Q9BYV9 841 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 CHGBP05060 677 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 SCNN1DP51172 638 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 JMYQ8N9B5 988 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 M0R2C6 588 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 GPAA1O43292 621 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 H7C1D1 291 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 MBD4O95243 580 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 BTDP43251 543 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 DLGAP5Q15398 846 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 CFAP100Q494V2 611 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.41■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 MICALL2Q8IY33 904 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 ARMT1Q9H993 441 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-202ENST00000395560 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 LCORLQ8N3X6 602 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 IL25Q9H293 177 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 MYO1BO43795 1136 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 SPDYE6P0CI01 402 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 USP40Q9NVE5 1235 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 RHBDL3P58872 404 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 MAP4K1Q92918 833 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 ALX1Q15699 326 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 TEX11Q8IYF3 940 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 ZMYM6O95789 1325 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 SEC24BO95487 1268 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 APPP05067 770 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 USP5P45974 858 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 IDI2Q9BXS1 227 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 USP26Q9BXU7 913 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 SCN4AP35499 1836 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 WNT10BO00744 389 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 MCCP23508 829 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 EPS15P42566 896 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 PTH1RQ03431 593 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 VPS53Q5VIR6 699 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 HACL1Q9UJ83 578 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-202ENST00000395560 FOCADQ5VW36 1801 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-202ENST00000395560 PRKAB2O43741 272 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-202ENST00000395560 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-202ENST00000395560 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-202ENST00000395560 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-202ENST00000395560 NAPBQ9H115 298 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-202ENST00000395560 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms