RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384199.1

RNU6-1024P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1024, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1024P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PYGO2Q9BRQ0 406 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 EGLN1Q9GZT9 426 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 EFCC1Q9HA90 598 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PRDM9Q9NQV7 894 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SORL1Q92673 2214 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NFATC1O95644 943 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CD99P14209 185 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RHOQP17081 205 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLURP1P55000 103 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FSTL1Q12841 308 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NR5A1Q13285 461 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF585AQ6P3V2 769 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RD3Q7Z3Z2 195 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF329Q86UD4 541 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LYG1Q8N1E2 194 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF721Q8TF20 911 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KCNF1Q9H3M0 494 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GCM1Q9NP62 436 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TSKSQ9UJT2 592 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PLSCR5A0PG75 271 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 A8MU10 97 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GRID2O43424 1007 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BRINP1O60477 761 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PEX10O60683 326 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PLGP00747 810 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NR3C2P08235 984 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MAKP20794 623 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PTGER1P34995 402 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SELENOPP49908 381 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PDE3BQ13370 1112 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LEXMQ3ZCV2 418 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GLB1LQ6UWU2 654 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RNF207Q6ZRF8 634 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 Q6ZVH6 145 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CYFIP1Q7L576 1253 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LRP11Q86VZ4 500 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF398Q8TD17 642 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRMOQ9BU70 441 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ADAMTS10Q9H324 1103 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM191CA6NGB0 347 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRIM66O15016 1216 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RHOBTB3O94955 611 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 EOMESO95936 686 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ALDH2P05091 517 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FECHP22830 423 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 VEGFCP49767 419 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NHLRC1Q6VVB1 395 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM20CQ8IXL6 584 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ULK2Q8IYT8 1036 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GPR150Q8NGU9 434 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CEP41Q9BYV8 373 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF446Q9NWS9 450 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 STARD13Q9Y3M8 1113 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SOCS5O75159 536 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 WISP1O95388 367 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 YY1P25490 414 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DLK1P80370 383 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ICAM4Q14773 271 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NRN1LQ496H8 165 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NLGN2Q8NFZ4 835 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms