RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372090.5

TOE1-201, Transcript of target of EGR1, exonuclease, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOE1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOE1-201	ENST00000372090	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PLCB4	Q15147	1175 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	AOX1	Q06278	1338 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	FCHSD2	O94868	740 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SNCB	Q16143	134 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	DLC1	Q96QB1	1528 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	ENO4	A6NNW6	628 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CFAP45	Q9UL16	551 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SPG7	Q9UQ90	795 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	MET	P08581	1390 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TMEM232	C9JQI7	657 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	STX10	O60499	249 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	STIM1	Q13586	685 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	NFE2L2	Q16236	605 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PTPN21	Q16825	1174 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	COG1	Q8WTW3	980 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CENPH	Q9H3R5	247 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PFKFB2	O60825	505 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	UBASH3A	P57075	661 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TUBB2A	Q13885	445 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	NEDD4	P46934	1319 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PRKAR2B	P31323	418 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PTH1R	Q03431	593 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	DESI2	Q9BSY9	194 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	BATF3	Q9NR55	127 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PYGL	P06737	847 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	E2F5	Q15329	346 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PDE6B	P35913	854 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	C3	P01024	1663 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	NDUFAB1	O14561	156 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	IKBKB	O14920	756 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	AMPH	P49418	695 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	KIAA1328	Q86T90	577 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	FSIP1	Q8NA03	581 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090		A0A0U1RQJ8	604 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	PPFIA2	O75334	1257 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CTAGE8	P0CG41	777 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	NEFH	P12036	1026 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	NLRP12	P59046	1061 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	FUK	Q8N0W3	1084 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	TC2N	Q8N9U0	490 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	INTS13	Q9NVM9	706 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	FANCL	Q9NW38	375 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	SKOR1	P84550	965 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	ACCSL	Q4AC99	568 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	TCP11	Q8WWU5	503 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CABP1	Q9NZU7	370 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TOE1-201	ENST00000372090	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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