RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369875.3

CNNM2-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM2, Length 2,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2-201ENST00000369875 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.06■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 RIMBP2O15034 1052 aa29.06■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 CCT2P78371 535 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.06■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 PFKFB2O60825 505 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 ZBTB22O15209 634 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 JAK2O60674 1132 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 GRIK5Q16478 980 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 MPNDQ8N594 471 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 TOMM22Q9NS69 142 aa29.05■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 IL1R1P14778 569 aa29.04■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 LTBP1Q14766 1721 aa29.04■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.04■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 H0YIN7 160 aa29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 CHD4Q14839 1912 aa29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 PPARAQ07869 468 aa29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 FBXL16Q8N461 479 aa29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 CHRNA5P30532 468 aa29.01■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 DDX11Q96FC9 970 aa29.01■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.01■■■□□ 2.24
CNNM2-201ENST00000369875 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa29.01■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 KDM4AO75164 1064 aa29.01■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.01■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.01■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 PTMSP20962 102 aa29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 STAG1Q8WVM7 1258 aa29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 QSER1Q2KHR3 1735 aa29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 CNNM2Q9H8M5 875 aa29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 MTMR6Q9Y217 621 aa29■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 KRT23Q9C075 422 aa28.99■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 SMIM22K7EJ46 135 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 PPFIA3O75145 1194 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 F13A1P00488 732 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 PDCP20941 246 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 EVCP57679 992 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 FBXW7Q969H0 707 aa28.98■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 GSTO1P78417 241 aa28.97■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 STYK1Q6J9G0 422 aa28.97■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 CTDNEP1O95476 244 aa28.96■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 GTF2IP78347 998 aa28.96■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 FAM184AQ8NB25 1140 aa28.96■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 COA1Q9GZY4 146 aa28.96■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 USP17L12C9JPN9 530 aa28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 USP17L21D6R901 530 aa28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 DOK7Q18PE1 504 aa28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 CTR9Q6PD62 1173 aa28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 TMEM87BQ96K49 555 aa28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CNNM2-201ENST00000369875 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.95■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.95■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 SENP2Q9HC62 589 aa28.95■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28.95■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.94■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.94■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.94■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.94■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 G3V3G9 751 aa28.93■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.93■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.93■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.93■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.93■■■□□ 2.22
CNNM2-201ENST00000369875 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms