RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 PLCB3Q01970 1234 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SMIM23A6NLE4 172 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 UVSSAQ2YD98 709 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 NEK11Q8NG66 645 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 KRT5P13647 590 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 A0A1W2PRG0 241 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 FAM182BQ5T319 152 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SPATA5Q8NB90 893 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PIK3C2GO75747 1445 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 ABCC2Q92887 1545 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 BIRC3Q13489 604 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 GCKRQ14397 625 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC175P0C221 793 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 B4DLN1 442 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SV2BQ7L1I2 683 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 ATP10AO60312 1499 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 HSF2BPO75031 334 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TAF12Q16514 161 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SNX21Q969T3 373 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC42Q96M95 316 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 ATP7AQ04656 1500 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SPAG1Q07617 926 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SMC5Q8IY18 1101 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 BCS1LQ9Y276 419 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TRAF5O00463 557 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 STAMBPO95630 424 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 LTKP29376 864 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 KRT9P35527 623 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 GTF2IP78347 998 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 DOK7Q18PE1 504 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 BICDL2A1A5D9 508 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 APPBP2Q92624 585 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CTAGE8P0CG41 777 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PDE4DQ08499 809 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 BRAPQ7Z569 592 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 NOD1Q9Y239 953 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 RAD50Q92878 1312 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PPIP5K2O43314 1243 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 KCNQ4P56696 695 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 LPIN2Q92539 896 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PZPP20742 1482 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 NSMFQ6X4W1 530 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CEP112Q8N8E3 955 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 IQUBQ8NA54 791 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TACC1O75410 805 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SCNN1DP51172 638 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 MCM6Q14566 821 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 VPS16Q9H269 839 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SH2D4AQ9H788 454 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 POTEB2H3BUK9 544 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CHL1O00533 1208 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SLC1A4P43007 532 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 KIFC2Q96AC6 838 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CFBP00751 764 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 GYG1P46976 350 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.083e-6■■■□□ 16.8
PTPRK-207ENST00000368226 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 DYMQ7RTS9 669 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CAVIN2O95810 425 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 DEXIO95424 95 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 KIF5AQ12840 1032 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC25Q86WR0 208 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC63Q8NA47 563 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 STAMQ92783 540 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-207ENST00000368226 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms