RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC45Q96CN5 670 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 INSRP06213 1382 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 BACH1O14867 736 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF5O00463 557 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF14Q5TI25 921 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CEP83Q9Y592 693 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0232Q92628 1395 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 PLCB3Q01970 1234 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 GGA1Q9UJY5 639 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 MAST3O60307 1309 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 VAV2P52735 878 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRTO14522 1441 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CUTAO60888 179 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM1O75626 825 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRL2O95490 1459 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.79■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 FERP16591 822 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 PDE4DQ08499 809 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ATP10AO60312 1499 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 GJC1P36383 396 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM14Q14142 442 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 FAM212AQ96EL1 285 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.243e-6■■□□□ 12.1
CCSAP-203ENST00000366687 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5JP18859 108 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 TNNC1P63316 161 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 MLKLQ8NB16 471 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF10O15013 1369 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA4P34932 840 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 FBF1Q8TES7 1133 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 KIF4AO95239 1232 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TTC38Q5R3I4 469 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 VWA3BQ502W6 1294 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TAF5LO75529 589 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms