RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 KRT222Q8N1A0 295 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 LIN9Q5TKA1 542 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CCT6BQ92526 530 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 DCTPP1Q9H773 170 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 IP6K1Q92551 441 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 TIGD1Q96MW7 591 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 TRIM7Q9C029 511 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 POLKQ9UBT6 870 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 DEXIO95424 95 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 MSL1Q68DK7 614 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 ELP1O95163 1332 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 TRAF5O00463 557 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 ZWINTO95229 277 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 STX17P56962 302 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 TYRO3Q06418 890 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CEP85Q6P2H3 762 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC169A6NNP5 214 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 AK2P54819 239 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 ZBED4O75132 1171 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CHST3Q7LGC8 479 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 DAAM2Q86T65 1068 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 BTG4Q9NY30 223 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 EYA2O00167 538 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-202ENST00000361368 PDE8AO60658 829 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 TNFAIP3P21580 790 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ATP5DP30049 168 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 H0YIN7 160 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 TRIM14Q14142 442 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 E7EVH7 732 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 LPXNO60711 386 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 MCM6Q14566 821 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 HAUS7Q99871 368 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 AZI2Q9H6S1 392 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ITGA6P23229 1130 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 SETDB1Q15047 1291 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 HOXC9P31274 260 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 CRCPO75575 148 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 PLIN2Q99541 437 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 JAG2Q9Y219 1238 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF174Q15697 407 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 M0QZ92 97 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 DNM2P50570 870 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 SPOPO43791 374 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 EYA1Q99502 592 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 RASA3Q14644 834 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC25Q86WR0 208 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 CLUL1Q15846 466 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 ABCC1P33527 1531 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 DAPK3O43293 454 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 MYL5Q02045 173 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 PPP2R5BQ15173 497 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 PDE4DQ08499 809 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 CHMP2AO43633 222 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 RFX1P22670 979 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-202ENST00000361368 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms