RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ATP10AO60312 1499 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM7Q9C029 511 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GBP1P32455 592 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R7Q15435 360 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF14Q5TI25 921 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CEP85Q6P2H3 762 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DAAM2Q86T65 1068 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RGS22Q8NE09 1264 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 IWS1Q96ST2 819 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MNAT1P51948 309 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GNA14O95837 355 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FYB2Q5VWT5 728 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NT5C2P49902 561 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MIS12Q9H081 205 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LIG1P18858 919 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MYL5Q02045 173 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ATP10DQ9P241 1426 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CIB2O75838 187 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 AFMP43652 599 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB16Q05516 673 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TCHPQ9BT92 498 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DNAI1Q9UI46 699 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FAM83GA6ND36 823 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM37O94972 964 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LGSNQ5TDP6 509 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SIRT1Q96EB6 747 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 VCXQ9H320 206 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TNFAIP1Q13829 316 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MTMR3Q13615 1198 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DACT1Q9NYF0 836 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZWINTO95229 277 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SEPT6Q14141 434 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF11Q86T75 865 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 POTEDQ86YR6 584 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 IP6K1Q92551 441 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CUTAO60888 179 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 P4HA1P13674 534 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT17Q6IS24 598 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 IFT20Q8IY31 132 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SNRKQ9NRH2 765 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CHMP4BP1P59074 171 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TEKT1Q969V4 418 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 STRN3Q13033 797 aa6.73□□□□□ -1.33
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