RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.6■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.6■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 PRKAB2O43741 272 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 FGD1P98174 961 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 AOC3Q16853 763 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 PODNQ7Z5L7 613 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 SLF2Q8IX21 1173 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 E7EWF7 191 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 PPIP5K2O43314 1243 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 BAG3O95817 575 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 AK2P54819 239 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF384Q8TF68 577 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CLDN4-201ENST00000340958 RPS6KB1P23443 525 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 ECE2O60344 883 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 TRDNQ13061 729 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 ALX1Q15699 326 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 F8W031 263 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 ANKRD1Q15327 319 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 GRIK5Q16478 980 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 TTC14Q96N46 770 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 TMX3Q96JJ7 454 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 PSMD1Q99460 953 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 ZMYM6O95789 1325 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 NCOA7Q8NI08 942 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 USP5P45974 858 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 COL4A5P29400 1685 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 USP17L3A6NCW0 530 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 USP17L4A6NCW7 530 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 BTDP43251 543 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 CERS3Q8IU89 383 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 MXD3Q9BW11 206 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 TOMM22Q9NS69 142 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN4-201ENST00000340958 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 Q6ZUG5 572 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 PLCG2P16885 1265 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 MCM5P33992 734 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 PPARAQ07869 468 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 CHST3Q7LGC8 479 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 CERS5Q8N5B7 392 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 SCNN1DP51172 638 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 PPP4CP60510 307 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 NIM1KQ8IY84 436 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 VPS33BQ9H267 617 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 TEX11Q8IYF3 940 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 TEKT1Q969V4 418 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 KRT23Q9C075 422 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 NBPF3Q9H094 633 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN4-201ENST00000340958 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms