RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.47■■□□□ 1.35
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CCDC71-201ENST00000321895 F8W031 263 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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CCDC71-201ENST00000321895 E7EWF7 191 aa23.4■■□□□ 1.34
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CCDC71-201ENST00000321895 RUFY3Q7L099 469 aa23.4■■□□□ 1.34
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CCDC71-201ENST00000321895 CTR9Q6PD62 1173 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC71-201ENST00000321895 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC71-201ENST00000321895 OGFOD1Q8N543 542 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC71-201ENST00000321895 CPA1P15085 419 aa23.35■■□□□ 1.33
CCDC71-201ENST00000321895 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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CCDC71-201ENST00000321895 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
CCDC71-201ENST00000321895 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CCDC71-201ENST00000321895 USP17L12C9JPN9 530 aa23.35■■□□□ 1.33
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