RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 CD99L2Q8TCZ2 262 aa31.68■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 PANK1Q8TE04 598 aa31.68■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 BRI3BPQ8WY22 251 aa31.68■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 MYH13Q9UKX3 1938 aa31.68■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 MS4A1P11836 297 aa31.67■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 LPIN2Q92539 896 aa31.67■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 SIL1Q9H173 461 aa31.67■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 GTF2A2P52657 109 aa31.66■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 CAP1Q01518 475 aa31.66■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 PTPN22Q9Y2R2 807 aa31.66■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 CSADQ9Y600 493 aa31.66■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 SPDYE5A6NIY4 337 aa31.65■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 ATP8B2P98198 1209 aa31.65■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 SP3Q02447 781 aa31.65■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 HHIPL2Q6UWX4 724 aa31.65■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 SSH3Q8TE77 659 aa31.65■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.65■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 BRCA2P51587 3418 aa31.65■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 TMOD2Q9NZR1 351 aa31.64■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa31.64■■■□□ 2.66
RP9-201ENST00000297157 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa31.63■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 CCL15Q16663 113 aa31.63■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 OTUD5Q96G74 571 aa31.63■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 EFCC1Q9HA90 598 aa31.63■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 SLC5A1P13866 664 aa31.62■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 ARMC5Q96C12 935 aa31.62■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 WDR66Q8TBY9 1149 aa31.61■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 ATP2B3Q16720 1220 aa31.6■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 FAM43AQ8N2R8 423 aa31.6■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 HOOK2Q96ED9 719 aa31.6■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 WRNIP1Q96S55 665 aa31.6■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 PDE3AQ14432 1141 aa31.59■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 ERO1BQ86YB8 467 aa31.59■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa31.59■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 POTEFA5A3E0 1075 aa31.58■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.58■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
RP9-201ENST00000297157 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 PPIL2Q13356 520 aa31.56■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 DCAF15Q66K64 600 aa31.56■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 CEP85Q6P2H3 762 aa31.56■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa31.56■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa31.56■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 CETPP11597 493 aa31.55■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 TFCP2Q12800 502 aa31.55■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 DDX19BQ9UMR2 479 aa31.55■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 IRF6O14896 467 aa31.54■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 FAM151AQ8WW52 585 aa31.54■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 COG6Q9Y2V7 657 aa31.54■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 SALL1Q9NSC2 1324 aa31.53■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 PRDX5P30044 214 aa31.53■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 SNAPC2Q13487 334 aa31.53■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 C20orf194Q5TEA3 1177 aa31.53■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 ZNF341Q9BYN7 854 aa31.53■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 BTBD19C9JJ37 291 aa31.52■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 DIXDC1Q155Q3 683 aa31.52■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 AKAP2Q9Y2D5 859 aa31.52■■■□□ 2.64
RP9-201ENST00000297157 TLR2O60603 784 aa31.51■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 TIMM10P62072 90 aa31.51■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 PPATQ06203 517 aa31.51■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 ARHGEF6Q15052 776 aa31.51■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa31.51■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 ZNF333Q96JL9 665 aa31.51■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 ZNF112Q9UJU3 913 aa31.51■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 A0A1B0GUL7 405 aa31.5■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 ADORA1P30542 326 aa31.5■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 INPP5BP32019 993 aa31.5■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 GPR108Q9NPR9 543 aa31.5■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa31.49■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 SEMA3EO15041 775 aa31.49■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 PHKA1P46020 1223 aa31.49■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 NFIAQ12857 509 aa31.49■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 MIGA2Q7L4E1 593 aa31.49■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa31.49■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 LDHBP07195 334 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 CCDC102BQ68D86 513 aa31.48■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 PCDH10Q9P2E7 1040 aa31.48■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 FAM198AQ9UFP1 575 aa31.48■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 DENND2AQ9ULE3 1009 aa31.48■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 XAGE2Q96GT9 111 aa31.47■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 KCNH4Q9UQ05 1017 aa31.47■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 SIRT2Q8IXJ6 389 aa31.46■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 RFX7Q2KHR2 1363 aa31.45■■■□□ 2.63
RP9-201ENST00000297157 ATRNL1Q5VV63 1379 aa31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.5 ms