RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 YEATS4O95619 227 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 IGKV5-2P06315 115 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 WTAPQ15007 396 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CA8P35219 290 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ANO1Q5XXA6 986 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC175P0C221 793 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TRAF1Q13077 416 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 DIP2AQ14689 1571 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 GPAA1O43292 621 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 FAM89AQ96GI7 184 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM87BQ96K49 555 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 USP28Q96RU2 1077 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 IFNKQ9P0W0 207 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SCRN1Q12765 414 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 RTN1Q16799 776 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ADALQ6DHV7 355 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CATIPQ7Z7H3 387 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 DIP2BQ9P265 1576 aa14□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 BAG3O95817 575 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 GNAT2P19087 354 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 STK32BQ9NY57 414 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 IMPACTQ9P2X3 320 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 BMP15O95972 392 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 RFX7Q2KHR2 1363 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CIAO1O76071 339 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TCIRG1Q13488 830 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 MICALCLQ6ZW33 695 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 RAB34Q9BZG1 259 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CASQ1P31415 396 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL10Q6JEL2 608 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 IL25Q9H293 177 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 MYL5Q02045 173 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 MAP9Q49MG5 647 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 HOOK3Q86VS8 718 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 RESTQ13127 1097 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 DDB1Q16531 1140 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ESR2Q92731 530 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ITGA6P23229 1130 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ZAP70P43403 619 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ATG3Q9NT62 314 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF202O95125 648 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 FAM193AP78312 1265 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 PYCARDQ9ULZ3 195 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 KIF5CO60282 957 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC24Q50LG9 513 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 PARP3Q9Y6F1 533 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 NLRP12P59046 1061 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1W2PQ27 194 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1W2PQ64 194 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1W2PQD8 194 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 MCM3P25205 808 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 C6orf163Q5TEZ5 329 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 KRT222Q8N1A0 295 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA1468Q9P260 1216 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 CDC25BP30305 580 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 B4E1Z4 1266 aa13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms