RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292199.6

NLRX1-201, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRX1, Length 3,744 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-201ENST00000292199 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
NLRX1-201ENST00000292199 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.53■□□□□ 0.24
NLRX1-201ENST00000292199 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
NLRX1-201ENST00000292199 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NLRX1-201ENST00000292199 GTF2IP78347 998 aa16.52■□□□□ 0.24
NLRX1-201ENST00000292199 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.52■□□□□ 0.24
NLRX1-201ENST00000292199 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SCNN1DP51172 638 aa16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 NMT2O60551 498 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 KINO60870 393 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 MECOMQ03112 1051 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 PDILTQ8N807 584 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 FSIP1Q8NA03 581 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 UBE4AQ14139 1066 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 USP28Q96RU2 1077 aa16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 A0A1B0GVL5 298 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 PFKFB2O60825 505 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 IQCA1Q86XH1 822 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CFAP45Q9UL16 551 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 DISP2A7MBM2 1401 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 USP17L8P0C7I0 530 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 PPARAQ07869 468 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 RTN1Q16799 776 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 LRSAM1Q6UWE0 723 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.5■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 BECN2A8MW95 431 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 MMP10P09238 476 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ANTXR2P58335 489 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 HOMER1Q86YM7 354 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ESR2Q92731 530 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 MXD3Q9BW11 206 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 GGA1Q9UJY5 639 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 FGFR2P21802 821 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.49■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 MAP3K11Q16584 847 aa16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 APOA5Q6Q788 366 aa16.48■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 NR1I2O75469 434 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CTDNEP1O95476 244 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CDC27P30260 824 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 KRT23Q9C075 422 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.47■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 TCP10Q12799 353 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 PHLPP1O60346 1717 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 TNKSO95271 1327 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CCDC192P0DO97 292 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 GPSM2P81274 684 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 UIMC1Q96RL1 719 aa16.46■□□□□ 0.23
NLRX1-201ENST00000292199 FOXP2O15409 715 aa16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 CDKL5O76039 1030 aa16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 CPVLQ9H3G5 476 aa16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 GYS1P13807 737 aa16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 ARID3AQ99856 593 aa16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.45■□□□□ 0.22
NLRX1-201ENST00000292199 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms