RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 LRRC31Q6UY01 552 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 CARD6Q9BX69 1037 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 PPFIA4O75335 1185 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 CNTROBQ8N137 903 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 COL15A1P39059 1388 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 H7C1W4 665 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 CCP110O43303 1012 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 KRT85P78386 507 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 APOBRQ0VD83 1088 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 LONRF2Q1L5Z9 754 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 COPRSQ9NQ92 184 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 TJP1Q07157 1748 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 KCNQ4P56696 695 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 ERLIN2O94905 339 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 CCDC151A5D8V7 595 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 KLHL33A6NCF5 533 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 FOXO4P98177 505 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 SEMA3FQ13275 785 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD65E5RJM6 399 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 KAT2BQ92831 832 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 BRD3Q15059 726 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 HOMER1Q86YM7 354 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 RABGGTAQ92696 567 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 PALLDQ8WX93 1383 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 TICAM2Q86XR7 235 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 TTC14Q96N46 770 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 TRIM37O94972 964 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 BIRC2Q13490 618 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 NBPF11Q86T75 865 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 MIEF2Q96C03 454 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 SCP2P22307 547 aa25.14■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 GPATCH3Q96I76 525 aa25.14■■□□□ 1.62
PITX1-201ENST00000265340 SBF2Q86WG5 1849 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 NRDCO43847 1150 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 HSPA4P34932 840 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 EPC1Q9H2F5 836 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 SIK1P57059 783 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 TFCP2Q12800 502 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 GJB2P29033 226 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 BTAF1O14981 1849 aa25.12■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 ERCC3P19447 782 aa25.12■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.12■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 GBP6Q6ZN66 633 aa25.12■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 NHSQ6T4R5 1651 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 RUFY3Q7L099 469 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 PLCD4Q9BRC7 762 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 AK2P54819 239 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 HDXQ7Z353 690 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 STARD3NLO95772 234 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 TCIRG1Q13488 830 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 H0YHG0 523 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 SARNPP82979 210 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 ITPK1Q13572 414 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms