RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATG3Q9NT62 314 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PDE4BQ07343 736 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DYNC1I1O14576 645 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SIK1P57059 783 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PICALMQ13492 652 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BTBD18B2RXH4 712 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CAVIN2O95810 425 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MCM7P33993 719 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IGSF3O75054 1194 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NCAPD2Q15021 1401 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PGBD1Q96JS3 809 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM75PA6NK02 468 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PNOCQ13519 176 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF827Q17R98 1081 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DNAI1Q9UI46 699 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHRNDQ07001 517 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RESTQ13127 1097 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMEM87BQ96K49 555 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UBXN4Q92575 508 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSPY3P0CV98 308 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSPY8P0CW00 308 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SUSD4Q5VX71 490 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMTC2Q8N394 836 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PFKFB1P16118 471 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GSDMDP57764 484 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 USP17L12C9JPN9 530 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 USP17L21D6R901 530 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RIMBP2O15034 1052 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CIAO1O76071 339 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UIMC1Q96RL1 719 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF609O15014 1411 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.2■■□□□ 1.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UBA7P41226 1012 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TEX35Q5T0J7 233 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GPR108Q9NPR9 543 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GNAT2P19087 354 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RASGRF1Q13972 1273 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC96Q2M329 555 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PARP10Q53GL7 1025 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IDEP14735 1019 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ADD2P35612 726 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GNG11P61952 73 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 STIM1Q13586 685 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 APOA5Q6Q788 366 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CAGE1Q8TC20 777 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LCORLQ8N3X6 602 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ADALQ6DHV7 355 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms