RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 CFAP45Q9UL16 551 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 JAK2O60674 1132 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CYP21A2P08686 494 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 ADRA2BP18089 450 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 RXRBP28702 533 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 APBA3O96018 575 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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VGF-201ENST00000249330 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 SLC51AQ86UW1 340 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 SPATA5Q8NB90 893 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 NEMFO60524 1076 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CEP135Q66GS9 1140 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 SARM1Q6SZW1 724 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CASZ1Q86V15 1759 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 GYG1P46976 350 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CNBD1Q8NA66 436 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 IQCB1Q15051 598 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 CTAGE5O15320 804 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 STX1AQ16623 288 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 ZNF592Q92610 1267 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 NEK1Q96PY6 1258 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 TICAM2Q86XR7 235 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 APPBP2Q92624 585 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 ADD2P35612 726 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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VGF-201ENST00000249330 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 FOXP2O15409 715 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 ZNF827Q17R98 1081 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 DDX11Q96FC9 970 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 Q6ZUG5 572 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-201ENST00000249330 KLRK1P26718 216 aa23.45■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.45■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.45■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 BECN2A8MW95 431 aa23.44■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 SERPINB2P05120 415 aa23.44■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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VGF-201ENST00000249330 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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VGF-201ENST00000249330 PDE6AP16499 860 aa23.43■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 UBE4AQ14139 1066 aa23.43■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 PTPN14Q15678 1187 aa23.43■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.43■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.43■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 SKILP12757 684 aa23.42■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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VGF-201ENST00000249330 FGD1P98174 961 aa23.42■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 DDR1Q08345 913 aa23.42■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.42■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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VGF-201ENST00000249330 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.41■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.41■■□□□ 1.34
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VGF-201ENST00000249330 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.41■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 ANO10Q9NW15 660 aa23.41■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 CCDC69A6NI79 296 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 USP27XA6NNY8 438 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 IGSF3O75054 1194 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 SCRN1Q12765 414 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 UBE3CQ15386 1083 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 VPS37DQ86XT2 251 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.4■■□□□ 1.34
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