RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC102BQ68D86 513 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 MRIQ9BWK5 157 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 PRDX5P30044 214 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 TTC22Q5TAA0 569 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1B0GUL7 405 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 XAGE2Q96GT9 111 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 LAMB1P07942 1786 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 APBB1O00213 710 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 TNFAIP1Q13829 316 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 RASGRF1Q13972 1273 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 SPRYD7Q5W111 196 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB22O15209 634 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 RAB11FIP3O75154 756 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 MAST3O60307 1309 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 SEMA3EO15041 775 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 TM4SF4P48230 202 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC6-201ENST00000243108 CDC45O75419 566 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 GJA5P36382 358 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 PDE1AP54750 535 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 WNK4Q96J92 1243 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 TNNI2P48788 182 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 PI16Q6UXB8 463 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 ABHD8Q96I13 439 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 FAM83AQ86UY5 434 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 TBC1D8O95759 1140 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 NFIAQ12857 509 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 STAP2Q9UGK3 403 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 UNCXA6NJT0 531 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF384Q8TF68 577 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 SDSP20132 328 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 ELP3Q9H9T3 547 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 ABCF2Q9UG63 623 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 AK9Q5TCS8 1911 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 MX1P20591 662 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXC6-201ENST00000243108 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 SREBF2Q12772 1141 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 TCP10Q12799 353 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 VGLL4Q14135 290 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 GAKO14976 1311 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 MCAMP43121 646 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 DGKZQ13574 1117 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 TNNI3KQ59H18 835 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXC6-201ENST00000243108 USP40Q9NVE5 1235 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms