RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 S100A7AQ86SG5 101 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 OR11H2Q8NH07 326 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 GGACTQ9BVM4 153 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 H3BMM0 161 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PAX9P55771 341 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 LYZP61626 148 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 DLK1P80370 383 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PSMG4Q5JS54 123 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 Q8NAQ8 132 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PSENENQ9NZ42 101 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 CXorf65A6NEN9 183 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 A8MTW9 85 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 TCRBP04435 133 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 C4BPBP20851 252 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 GALR1P47211 349 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 AKR1C1Q04828 323 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 NEU1Q99519 415 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 HERC2O95714 4834 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 ZNF98A6NK75 572 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 KNCNA6PVL3 124 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 C11orf94C9JXX5 98 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 H3BP45 60 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 H3BRN7 92 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 SSSCA1O60232 199 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 DEDDO75618 318 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 ASAH1Q13510 395 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 X6R8D5 127 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-218ENST00000629219 A0A087X0K7 114 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 IL5P05113 134 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 OR2F1Q13607 317 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ZNF846Q147U1 533 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TEPPQ6URK8 271 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ZNF546Q86UE3 836 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RPRMQ9NS64 109 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 NUDT15Q9NV35 164 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C7orf66A4D0T2 115 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TMEM189A5PLL7 270 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 A6NHS1 94 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 HYPMO75409 117 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 AMBPP02760 352 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 CXCL2P19875 107 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RAP2BP61225 183 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PMS2P11Q13670 270 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
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