RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4F5	Q8NH21	305 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IL36B	Q9NZH7	164 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SRRM5	B3KS81	715 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	VDAC1	P21796	283 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	NPY1R	P25929	384 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR183	P32249	361 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ID1	P41134	155 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF90	Q03938	601 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	JMJD8	Q96S16	334 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0A6YYD4	124 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0G2JLM5	398 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SNURFL	B1AK76	121 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SSSCA1	O60232	199 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CST7	O76096	145 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINE2	P07093	398 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TSKU	Q8WUA8	353 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF183	Q96D59	192 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PPM0	123 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SOCS1	O15524	211 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A6	P12236	298 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SRD5A1	P18405	259 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	DSCR9	P59020	149 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		Q56UQ5	140 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LCN12	Q6JVE5	192 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OSR2	Q8N2R0	312 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BUT2	72 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR1D	P28221	377 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS4	P56470	323 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SP6	Q3SY56	376 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf159	Q96HA4	380 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFSF12	O43508	249 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	WIPF1	O43516	503 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	FABP2	P12104	132 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL1	P22362	96 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	GATA3	P23771	443 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM50B	P56557	158 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	LY6E	Q16553	131 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM42	Q69YG0	159 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf35	Q96D05	121 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	RCHY1	Q96PM5	261 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	GAFA1	Q96PS6	74 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	VCX2	Q9H322	139 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		5.84	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4C46	A6NHA9	309 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXH1	O75593	365 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV3-1	P01715	115 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	IER3	P46695	156 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	VSIR	Q9H7M9	311 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	HES4	Q9HCC6	221 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LETMD1-238	ENST00000623495	hADV38S2	A0JD32	116 aa		5.83	□□□□□ -1.48

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