RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2G1P62253 170 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf46Q8TAG6 207 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TNFRSF14Q92956 283 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV2-11P01706 119 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PSG1P11464 419 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 CAMPP49913 170 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 PRRX1P54821 245 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 GPR82Q96P67 336 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ABCA1O95477 2261 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 G0S2P27469 103 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 LCN12Q6JVE5 192 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 INSIG2Q9Y5U4 225 aa10.6□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 MUC6Q6W4X9 2439 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 NTF3P20783 257 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA45Q537H7 98 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 FAM120AOSQ5T036 256 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01560Q8TB33 94 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 ZFHX3Q15911 3703 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM12Q96EX1 92 aa10.59□□□□□ -0.71
C9orf170-201ENST00000623052 B9A039 149 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1-17P01599 117 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 ATOH7Q8N100 152 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 FMC1Q96HJ9 113 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 LYZP61626 148 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 SSX8Q7RTT4 187 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 Q86TA4 180 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 M0QZ24 198 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 MMDQ15546 238 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 ASCL2Q99929 193 aa10.58□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 LY6HO94772 140 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 CDSNQ15517 529 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf77Q96MU5 243 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF492Q9P255 531 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 C2orf70A6NJV1 201 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 K7EIM0 57 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 TOX4O94842 621 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 CD3EP07766 207 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 PPIAL4GP0DN37 164 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 IGLC2P0DOY2 106 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 IGLC3P0DOY3 106 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.57□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 VSTM5A8MXK1 200 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 NBL1P41271 181 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 CA7P43166 264 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf54Q6UWD8 224 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 HBBP68871 147 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 RBPJQ06330 500 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 PMCHL1Q16048 86 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 NGBQ9NPG2 151 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 TIMM23O14925 209 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 CT83Q5H943 113 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 OR8B3Q8NGG8 313 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 OR8B2Q96RD0 313 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.56□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 M0QZK8 103 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF124Q15973 351 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 MUC15Q8N387 334 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 RPEQ96AT9 228 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 VKORC1Q9BQB6 163 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 CFHR4Q92496 578 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 OTORQ9NRC9 128 aa10.55□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 P01737 135 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf170-201ENST00000623052 RBP4P02753 201 aa10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms