RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593738.1

LTBP4-208, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 302 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-208	ENST00000593738	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	JTB	O76095	146 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	SELENOT	P62341	195 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	ASAH1	Q13510	395 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	CXorf65	A6NEN9	183 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	PSMB3	P49720	205 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	MEOX2	P50222	304 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18	1e-6	■■■■□ 19.4
LTBP4-208	ENST00000593738	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	GPR82	Q96P67	336 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	GGACT	Q9BVM4	153 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	NUPR2	A6NF83	97 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	CCS	O14618	274 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	IL5	P05113	134 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	ORM2	P19652	201 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	GALR1	P47211	349 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738		H3BMM0	161 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738		L7N2F9	121 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	ISLR	O14498	428 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	UPK1B	O75841	260 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	CCNK	O75909	580 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	VAMP2	P63027	116 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	S100A7A	Q86SG5	101 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738		K7EPK0	472 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	SOCS3	O14543	225 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	DEDD	O75618	318 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	C4BPB	P20851	252 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	PLP1	P60201	277 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	RYR3	Q15413	4870 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-208	ENST00000593738	HYPM	O75409	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	RAP2B	P61225	183 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	LINC00869	P0C866	280 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	MIF	P14174	115 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738		H3BRN7	92 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	ARL16	Q0P5N6	197 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738		Q8NAQ8	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	GOSR2	O14653	212 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	OR5G3	P0C626	314 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	BCAP31	P51572	246 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	IL15RA	Q13261	267 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LTBP4-208	ENST00000593738	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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