RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 TGOLN2O43493 480 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV1-40P01703 118 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC3BP05452 202 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYBA1P05813 215 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SRD5A1P18405 259 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR183P32249 361 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP1-1Q07627 177 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX38Q6PEX7 206 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 RABAC1Q9UI14 185 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 DNHD1Q96M86 4753 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PRE2 83 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CLDN34H7C241 214 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHG4P01861 327 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CTSGP08311 255 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CEBPGP53567 150 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 IL17RELQ6ZVW7 336 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM14CQ9P0S9 112 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00527Q9UJ94 153 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ELANEP08246 267 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC19AQ6UXS0 136 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PATE2Q6UY27 113 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF491Q8N8L2 437 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4F17Q8NGA8 305 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A2Q9BXI2 301 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS13CQ709C8 3753 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-23P01764 117 aa17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXE3Q13461 319 aa17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N2B8 174 aa17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 S4R3C0 116 aa17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 JMJD1CQ15652 2540 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL3P36405 182 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2G2P60604 165 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CFHR3Q02985 330 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR82Q96P67 336 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PRELID1Q9Y255 219 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 F8W735 103 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa17.6■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF702PQ9H963 129 aa17.6■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM74A7A6NL05 159 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 C9JQL5 133 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BRN7 92 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL7P18124 248 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CD81P60033 236 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC140Q96MF4 163 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL26Q96S19 204 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CSPG4Q6UVK1 2322 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF727A8MUV8 499 aa17.58■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP17.58■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TVP23CQ96ET8 276 aa17.58■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 B4DEV8 164 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R036 132 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 GGCTO75223 188 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10J4P0C629 311 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCYAP1P18509 176 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMB8P28062 276 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 BMI1P35226 326 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RHEBQ15382 184 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF343Q6P1L6 599 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4X2Q8NGF9 303 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM7Q9BQ49 75 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRDL1Q9BU40 450 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV5A0A0B4J249 113 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA4O00483 81 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NBEAP1P0C6P0 100 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 MEOX2P50222 304 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf194Q5T5A4 169 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 Q71RC1 249 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CLRN3Q8NCR9 226 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NAT8Q9UHE5 227 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF98A6NK75 572 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 LY6G6DO95868 133 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NPPCP23582 126 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ADMP35318 185 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM241Q24JQ0 296 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TOMM20LQ6UXN7 152 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZS46 218 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 LYPD1Q8N2G4 141 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FXYD5Q96DB9 178 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 GRAMD2BQ96HH9 432 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BQ15 152 aa17.54■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM106AQ4KMX7 169 aa17.54■□□□□ 0.4
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