RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590740.2

AC060780.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC060780.1, Length 5,084 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC060780.1-202ENST00000590740 ROS1P08922 2347 aa6.69□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.69□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TDGF1P3P51864 188 aa6.69□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.69□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.69□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 OOSP1A8MZH6 123 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 CFHR1Q03591 330 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 GAGE2BQ13066 116 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNF124Q15973 351 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNF876PQ49A33 203 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 GAGE2EQ4V326 116 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 JPT2Q9H910 190 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 A0A087WX48 190 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNF138P52744 262 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 GUSBP1Q15486 140 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 METRNQ9UJH8 293 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ACACAQ13085 2346 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 A6NNC1 897 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNF688P0C7X2 276 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 HGFACQ04756 655 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 CST9LQ9H4G1 147 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 VGLL1Q99990 258 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.68□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 FREM3P0C091 2139 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 IL18BPO95998 194 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RCHY1Q96PM5 261 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 VCYO14598 125 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 CD177Q8N6Q3 437 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 NUP35Q8NFH5 326 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TMEM178BH3BS89 294 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 PAX4O43316 350 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 C3orf79P0CE67 100 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 GLRX5Q86SX6 157 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 GATD1Q8NB37 220 aa6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ZNF415Q09FC8 603 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 LINC00477Q96M19 166 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 DLEU1O43261 78 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 EFNA4P52798 201 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 REG4Q9BYZ8 158 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 CREBBPQ92793 2442 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TOMM40O96008 361 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 NTF4P34130 210 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 hDV102S1A0JD36 115 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 H0YJW9 148 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 SH2D1AO60880 128 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 DSCR9P59020 149 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 PSG3Q16557 428 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 LCN12Q6JVE5 192 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RASL10AQ92737 203 aa6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 RLFQ13129 1914 aa6.65□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.65□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.65□□□□□ -1.34
AC060780.1-202ENST00000590740 NDUFS8O00217 210 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms