RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF114Q8NC26 417 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 MDS2Q8NDY4 140 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 CYYR1Q96J86 154 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 D6R8Y8 96 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM262E9PQX1 116 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 COL4A3Q01955 1670 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 M0R381 172 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 RIPPLY3P57055 190 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TMPRSS3P57727 454 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 MAJINQ3KP22 176 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PF4V1P10720 104 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SELLP14151 372 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PAX1P15863 534 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00205P59089 165 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 NOTCH4Q99466 2003 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 GAGE13Q4V321 117 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 CST9LQ9H4G1 147 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ALPK3Q96L96 1907 aa8.46□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-205ENST00000577827 Q86TA4 180 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 H7C1H1 209 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 COL4A6Q14031 1691 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-205ENST00000577827 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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PTPRM-205ENST00000577827 PDE6HQ13956 83 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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PTPRM-205ENST00000577827 S4R3C0 116 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 H3BRM9 83 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRM-205ENST00000577827 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 A8MWV9 139 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 C15orf65H3BRN8 121 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM178BH3BS89 294 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-23P01764 117 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 TRGV3P03979 118 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 MLANAQ16655 118 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-205ENST00000577827 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.42□□□□□ -1.06
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