RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8orf88P0DMB2 117 aa13.31□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 MORN5Q5VZ52 161 aa13.31□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GUS0 222 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR7C2O60412 319 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 HAGHQ16775 308 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 KHDC3LQ587J8 217 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF152Q8N8N0 203 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM210AQ96ND0 272 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM231Q9H6L2 316 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 HAX1O00165 279 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 GUK1Q16774 197 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOR2AQ5JU69 321 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 TREM1Q9NP99 234 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 BMPR1BO00238 502 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM209BQ5JX69 171 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 S100A7AQ86SG5 101 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFNA1P01562 189 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 LEMD1Q68G75 181 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 RABAC1Q9UI14 185 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 GGCTO75223 188 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 GCHFRP30047 84 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMB3P49720 205 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 PROK1P58294 105 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 RARRES2Q99969 163 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 C20orf24Q9BUV8 137 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10J4P0C629 311 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXL1Q12952 345 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEA15Q15121 130 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 UQCC3Q6UW78 93 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR51M1Q9H341 326 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 I3L521 148 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE2G2P60604 165 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF414Q96IQ9 312 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAXXQ9BUH6 204 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF320A2RRD8 509 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 H3BRN7 92 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDUFA4O00483 81 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PYYP10082 97 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 S100A7P31151 101 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPT1P50897 306 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF503Q96F45 646 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 MANBALQ9NQG1 85 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF98A6NK75 572 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAGE4O60829 102 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCL2P10415 239 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPEL1Q2QD12 228 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 STXBP6Q8NFX7 210 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD28P10747 220 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 METTL26Q96S19 204 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 VAX2Q9UIW0 290 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD5P06127 495 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPPCP23582 126 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PMS2P11Q13670 270 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ICAM4Q14773 271 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM106AQ4KMX7 169 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 CST9LP1Q5W188 147 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 C18orf65Q6ZTR6 163 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRIMA1Q86XR5 153 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF24Q9Y225 148 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.8 ms