RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553417.1

PRMT5-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-208	ENST00000553417	LPAR6	P43657	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	RND2	P52198	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	CLDN12	P56749	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SCAND1	P57086	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417		K7EQD1	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC17A2	O00624	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	EI24	O14681	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	PITX3	O75364	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	RLN1	P04808	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	PSMB9	P28065	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	FCGR2C	P31995	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	RANBP1	P43487	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	GALR1	P47211	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	HSPA13	P48723	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	CRYBA4	P53673	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	LAGE3	Q14657	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	PRR4	Q16378	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	PSG3	Q16557	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417		Q9H521	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	TOMM40	O96008	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	F2R	P25116	425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	OR2F1	Q13607	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	PPY	P01298	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ORM1	P02763	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	GABRB1	P18505	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	FGL1	Q08830	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	INSL4	Q14641	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	MLANA	Q16655	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	RMI2	Q96E14	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC25A4	P12235	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	GNG2	P59768	71 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	HERV-K104	P61576	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	LYZ	P61626	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms