RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 NMSQ5H8A3 153 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-227ENST00000551441 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-227ENST00000551441 C16orf92Q96LL3 132 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-227ENST00000551441 PAX9P55771 341 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 KRTAP10-2P60368 255 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 UHRF2Q96PU4 802 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 RBKSQ9H477 322 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 RPRMQ9NS64 109 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 DOK5Q9P104 306 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 GAMTQ14353 236 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 AMTNQ6UX39 209 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 BAP18Q8IXM2 172 aa11.26□□□□□ -0.61
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CS-227ENST00000551441 C17orf77Q96MU5 243 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 ABHD1Q96SE0 405 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SLC25A22Q9H936 323 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 ISLRO14498 428 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 HTN1P15515 57 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 CCL18P55774 89 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 DTD1Q8TEA8 209 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SLC35E1Q96K37 410 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 RSG1Q9BU20 258 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 LYRM9A8MSI8 78 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 TAS2R19P59542 299 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 CLINT1Q14677 625 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SSX7Q7RTT5 188 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 NOXA1Q86UR1 476 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 RNF182Q8N6D2 247 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 FAT1Q14517 4588 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 B3GALNT1O75752 331 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 INSP01308 110 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 FGL1Q08830 312 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 U3KQ87 197 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 GABARAPH6UMI1 98 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 GABARAPO95166 117 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 ATP5G1P05496 136 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 IAPPP10997 89 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 TBPP20226 339 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 ATP5G3P48201 142 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 ALDH3B2P48448 385 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 GPR107Q5VW38 600 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 LINC01587Q99440 93 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 Q9H8V8 135 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 A8MTW9 85 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 MZT2AQ6P582 158 aa11.21□□□□□ -0.61
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CS-227ENST00000551441 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-227ENST00000551441 GPR132Q9UNW8 380 aa11.21□□□□□ -0.61
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CS-227ENST00000551441 ZNF98A6NK75 572 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 ORM2P19652 201 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 GALR1P47211 349 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 OR5I1Q13606 314 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 SMCO1Q147U7 214 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 A0A087WXM4 84 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 CBY3A6NI87 242 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 DISC1C4P0D8 188 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 CCR6P51684 374 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 RHOBP62745 196 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 ZNF738Q8NE65 137 aa11.19□□□□□ -0.62
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