RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549537.6

TMEM116-208, Transcript of transmembrane protein 116, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TMEM116, Length 1,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM116-208	ENST00000549537	LCE6A	A0A183	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537		A0A1B0GU03	582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	ATG12	O94817	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	TMEM50A	O95807	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	IFNA17	P01571	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	MB	P02144	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	TNFSF8	P32971	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	ETV6	P41212	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	SPCS3	P61009	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	FHL2	Q14192	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM116-208	ENST00000549537	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	CORT	O00230	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	GNG7	O60262	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	M6PR	P20645	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	SNCA	P37840	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	PPT1	P50897	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	SEC61G	P60059	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	DHODH	Q02127	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	NHLH2	Q02577	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	TMEM187	Q14656	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537		Q6ZWC4	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	STX12	Q86Y82	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	PRRT1	Q99946	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537		V9GYH0	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	YIF1A	O95070	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	FGL1	Q08830	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	ZNF79	Q15937	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537		A0A1W2PPV4	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	DFFB	O76075	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	NXPH3	O95157	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	CD5	P06127	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	CRYBB3	P26998	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	OPRK1	P41145	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	APOC4	P55056	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	HERV-K104	P63124	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM116-208	ENST00000549537	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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