RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 Q8WTZ3 238 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 NAT8Q9UHE5 227 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 A6NDX4 124 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRGV3P03979 118 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CTSGP08311 255 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RNF212Q495C1 297 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RNF2Q99496 336 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 HIVEP2P31629 2446 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 J3QLI3 93 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 FABP1P07148 127 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PF4V1P10720 104 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ADMP35318 185 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TPPP2P59282 170 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 FXYD5Q96DB9 178 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 OR5B12Q96R08 314 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 KLK15Q9H2R5 256 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 GNG5P63218 68 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZFP82Q8N141 532 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PGPA6NDG6 321 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PPP5D1E7EU14 171 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TOMM40O96008 361 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 IER3P46695 156 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 C17orf77Q96MU5 243 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 HELTA6NFD8 242 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 COLCA2A8K830 154 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 F6UZH7 168 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ATP5G2Q06055 141 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 LINC01551Q86U37 167 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CCDC140Q96MF4 163 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PRE2 83 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 IGHG2P01859 326 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CRYBA1P05813 215 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 OR5I1Q13606 314 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 OCC1Q8TAD7 63 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 MBD6Q96DN6 1003 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CR1P17927 2039 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZNF98A6NK75 572 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 M0QZK8 103 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 AP4M1O00189 453 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRBV12-3P01733 135 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 MT-ND4LP03901 98 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PLP1P60201 277 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 MLXQ9UH92 298 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 GP9P14770 177 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CENPWQ5EE01 88 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 H7BYZ3 331 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CLDN34H7C241 214 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SCGB2A1O75556 95 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TSPAN9O75954 239 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 GNG4P50150 75 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TMEM68Q96MH6 324 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 Q9H3A6 140 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ZNF320A2RRD8 509 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 B4DEV8 164 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms