RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 PRSS3P35030 304 aa10.46□□□□□ -0.73
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PTPRB-205ENST00000547715 SOHLH1Q5JUK2 328 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRB-205ENST00000547715 OR1S2Q8NGQ3 325 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRB-205ENST00000547715 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.46□□□□□ -0.73
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PTPRB-205ENST00000547715 ZNF414Q96IQ9 312 aa10.46□□□□□ -0.73
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PTPRB-205ENST00000547715 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRB-205ENST00000547715 PLEKHA2Q9HB19 425 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 MARCH11A6NNE9 402 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 KNCNA6PVL3 124 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 PPYP01298 95 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-48P01763 117 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 PTHLHP12272 177 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-205ENST00000547715 ADCYAP1P18509 176 aa10.4□□□□□ -0.74
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