RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 C12orf49Q9H741 205 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 HIGD1BQ9P298 99 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 HIGD1CA8MV81 97 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 IGHG3P01860 377 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 MGPP08493 103 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 COX8AP10176 69 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 LGALS7P47929 136 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 FXYD7P58549 80 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM258P61165 79 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 LPAL2Q16609 132 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 AMTNQ6UX39 209 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 EML6Q6ZMW3 1958 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 FREM3P0C091 2139 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 MGST3O14880 152 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 PGPA6NDG6 321 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 FGFRL1Q8N441 504 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 K7ERJ3 54 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 FAM222BQ8WU58 562 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 C11orf52Q96A22 123 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 RNF125Q96EQ8 232 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 VGLL1Q99990 258 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 PATE4P0C8F1 98 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 OTORQ9NRC9 128 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 ASCL2Q99929 193 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 H3BQ85 93 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-214ENST00000540109 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 TAX1BP3O14907 124 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 LEPP41159 167 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 PDE6HQ13956 83 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-214ENST00000540109 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.99□□□□□ -1.61
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