RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 NRGNQ92686 78 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF98A6NK75 572 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-204ENST00000538708 LINC00473A8K010 186 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-204ENST00000538708 G3V318 75 aa7.67□□□□□ -1.18
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PTPRB-204ENST00000538708 DKK1O94907 266 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 GAGE12BA1L429 117 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 GAGE7O76087 117 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 ELANEP08246 267 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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