RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-216ENST00000537568 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-216ENST00000537568 NAGKQ9UJ70 344 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-216ENST00000537568 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-216ENST00000537568 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-216ENST00000537568 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 A0A0G2JRQ6 117 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 A0A1B0GV90 55 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PPV4 95 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 C20orf202A1L168 122 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 K7EIL1 84 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 CCL24O00175 119 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 CDIPTO14735 213 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TGFBR3Q03167 851 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ARL16Q0P5N6 197 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 LINC01551Q86U37 167 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 PNKDQ8N490 385 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 UHRF2Q96PU4 802 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 HES4Q9HCC6 221 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 B4DSR2 109 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 SCGB2A1O75556 95 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 STAG3L2P0CL84 134 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 STAG3L3P0CL85 134 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 GZMHP20718 246 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 KITLGP21583 273 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 STHQ8IWL8 128 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 SFRP2Q96HF1 295 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TBX15Q96SF7 602 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 RNF2Q99496 336 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 FUT9Q9Y231 359 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 H3BP45 60 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 SYNGR1O43759 233 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 OR2H2O95918 312 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 HPRT1P00492 218 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 OR5G3P0C626 314 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 IAPPP10997 89 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 PSG1P11464 419 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 IL3RAP26951 378 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 RHOBP62745 196 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 MORN5Q5VZ52 161 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TEX29Q8N6K0 151 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 RDH5Q92781 318 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 VSIRQ9H7M9 311 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 IL36BQ9NZH7 164 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ODAMA1E959 279 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 TNFSF12O43508 249 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 NGFP01138 241 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 IGKV1D-33P01593 117 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 IGKV1-33P01594 117 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 CFHR2P36980 270 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 RAB7AP51149 207 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 ERVK-16P61578 105 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-216ENST00000537568 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms