RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	IER3	P46695	156 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	PRR27	Q6MZM9	219 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035		Q8N9W7	124 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	GNG7	O60262	68 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	IL4	P05112	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	PDLIM4	P50479	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	UBE2G1	P62253	170 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	OR2J3	O76001	311 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	NDUFB8	O95169	186 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	AMBP	P02760	352 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	CCL19	Q99731	98 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TOMM40	O96008	361 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035		Q56UQ5	140 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	FABP1	P07148	127 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	NPFF	O15130	113 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	MFAP4	P55083	255 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035		H3BRN7	92 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	NUDT11	Q96G61	164 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TCRA	P04437	139 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	BRS3	P32247	399 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	PRB1	P04280	392 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	NUPR1	O60356	82 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	S100A12	P80511	92 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	GPR82	Q96P67	336 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	RAB4B	P61018	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	THYN1	Q9P016	225 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	LINC00587	B1AMM8	73 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	ATP5J2	P56134	94 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-222	ENST00000524035	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms