RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFA7O95182 113 aa11.91□□□□□ -0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 AWAT1Q58HT5 328 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-206ENST00000517323 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-206ENST00000517323 H3BQ15 152 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-206ENST00000517323 H3BRN7 92 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-206ENST00000517323 C8orf88P0DMB2 117 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-206ENST00000517323 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-206ENST00000517323 SORL1Q92673 2214 aa11.83□□□□□ -0.52
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