RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q6Q795 121 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDZD9Q8IXQ8 264 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR6V1Q8N148 313 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM172AQ8WUF8 416 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 ITFG2Q969R8 447 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 BORCS7Q96B45 105 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 C2orf50Q96LR7 162 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPER1Q99527 375 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCTPQ9UKL6 214 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADCY9O60503 1353 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC144AA2RUR9 1427 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIF1BO60333 1816 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 CECR2Q9BXF3 1484 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGEF11O15085 1522 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDE6DO43924 150 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLV3-1P01715 115 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 OMPP47874 163 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 AESQ08117 197 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPINK9Q5DT21 86 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR51A2Q8NGJ7 313 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q8TAT8 98 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRRT1Q99946 306 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 GGACTQ9BVM4 153 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM126AQ9H061 195 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 TVP23BQ9NYZ1 205 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNFSF18Q9UNG2 199 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 MGAMO43451 1857 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV10A0A0B4J240 114 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUPR2A6NF83 97 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 F8W1H4 67 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 K7EIL1 84 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFB3O43676 98 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRP14P37108 136 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIGPP57054 158 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC00575Q6W349 94 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRINAQ7Z429 371 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR8J2Q8NGG1 315 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR5D14Q8NGL3 314 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR10K1Q8NGX5 313 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TP53RKQ96S44 253 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM4Q9C037 500 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 WFDC10AQ9H1F0 79 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 GLTPQ9NZD2 209 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLAC8Q9NZF1 115 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZGRF1Q86YA3 2104 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNS3Q68CZ2 1445 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 NIPSNAP2O75323 286 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPP14O95059 124 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPINK7P58062 85 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 AP3S2P59780 193 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 EDDM3AQ14507 147 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1orf134Q5TEV5 83 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 C2orf82Q6UX34 121 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 C4orf22Q6V702 233 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSMF1Q92530 271 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF122Q9H9V4 155 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM138Q9NPI0 162 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 NCOA1Q15788 1441 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 DOCK4Q8N1I0 1966 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 BDP1A6H8Y1 2624 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV4A0A0B4J268 109 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTL1A6NKG5 1358 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 E7EUB6 86 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 H3BRM9 83 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPYP01298 95 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLV1-51P01701 117 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPTBP11277 2137 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP5G3P48201 142 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 RRN3P1Q2M238 152 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM97Q5BJF2 176 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 C6orf52Q5T4I8 152 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYRM7Q5U5X0 104 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 C22orf39Q6P5X5 142 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TEN1Q86WV5 123 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 FREM3P0C091 2139 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUP98P52948 1817 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMIM23A6NLE4 172 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 A8MWV9 139 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 J3QRK9 145 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAX1BP3O14907 124 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 CST8O60676 142 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 ERC2-IT1O76042 136 aa-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms