RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SPG11Q96JI7 2443 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A096LNT2 108 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BRN7 92 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 AP4M1O00189 453 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2CO00762 179 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 GCGP01275 180 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TRGC2P03986 189 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 MSMBP08118 114 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 S100PP25815 95 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPWQ5EE01 88 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 NECAP1Q8NC96 275 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM68Q96MH6 324 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TXN2Q99757 166 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01548A6NM66 108 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 LY6G6DO95868 133 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A16P16260 332 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 LYZP61626 148 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 Q5PR19 223 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 THYN1Q9P016 225 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ITPR3Q14573 2671 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0U1RQK1 487 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 PEX7O00628 323 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V0E1O15342 81 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BKO60814 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2J3O76001 311 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 AMY1AP04745 511 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A6P06703 90 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BJP06899 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXA5P20719 270 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BOP23527 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BBP33778 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG4P50150 75 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BDP58876 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BCP62807 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 FRZBQ92765 325 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF125Q96EQ8 232 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 Q96MF0 132 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 OSTCQ9NRP0 149 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 IL36BQ9NZH7 164 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 EPDR1Q9UM22 224 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 S4R3C0 116 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 V9GYV3 84 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP6Q13023 2319 aa8.42□□□□□ -1.06
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 PGPA6NDG6 321 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NDX4 124 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 B4DSR2 109 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG7O60262 68 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 AVPP01185 164 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CTSGP08311 255 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TRGC1P0CF51 173 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HNF1AP20823 631 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 RANP62826 216 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5I1Q13606 314 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 LEMD1Q68G75 181 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.42□□□□□ -1.06
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