RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 ROMO1P60602 79 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 SPCS3P61009 180 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 HIST3H3Q16695 136 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 SPATA45Q537H7 98 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 TEN1Q86WV5 123 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 PRADC1Q9BSG0 188 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 PCTPQ9UKL6 214 aa-0.47□□□□□ -2.48
SENP6-210ENST00000487548 ROBO3Q96MS0 1386 aa-0.47□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ZNF727A8MUV8 499 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 B4DSR2 109 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 FXYD1O00168 92 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 PIRO00625 290 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TGOLN2O43493 480 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TIMM17BO60830 172 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RBP1P09455 135 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 OR2F1Q13607 317 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 C4orf22Q6V702 233 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 Q8TAT8 98 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 USE1Q9NZ43 259 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 HIVEP1P15822 2718 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ECM29Q5VYK3 1845 aa-0.48□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 UNC13CQ8NB66 2214 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 E7EUB6 86 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 PPYP01298 95 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TNNC2P02585 160 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 CD14P08571 375 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 COX7CP15954 63 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RHOBP62745 196 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 PRR15Q8IV56 129 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 KRT222Q8N1A0 295 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 PTH2Q96A98 100 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 CCDC90BQ9GZT6 254 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 HERC2O95714 4834 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 FAM236CP0DP71 79 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 SPRR2DP22532 72 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 FXYD4P59646 89 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 C8orf74Q6P047 294 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 Q86TA4 180 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 PXT1Q8NFP0 134 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 OR5D14Q8NGL3 314 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 CANT1Q8WVQ1 401 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 C2orf50Q96LR7 162 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 FBXO5Q9UKT4 447 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RNF11Q9Y3C5 154 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 LPAP08519 4548 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 FAM25EA8MYX2 175 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 CHP2O43745 196 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ERC2-IT1O76042 136 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TTRP02766 147 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 SERPINE1P05121 402 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 CALB1P05937 261 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 CXCL8P10145 99 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 Q6ZQY7 126 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 OR10K1Q8NGX5 313 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 LINC00467Q9BRT7 94 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 TMEM126AQ9H061 195 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 UCK1Q9HA47 277 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 KMT2AQ03164 3969 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 LAMA5O15230 3695 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.51□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 MYCBP2O75592 4640 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ANK2Q01484 3957 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 SIP14410 1827 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 LOC285556D6RIA3 1793 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF11O15085 1522 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 RFX7Q2KHR2 1363 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 A8MWV9 139 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 CYB5BO43169 146 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 SMIM17P0DL12 118 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 SRIP30626 198 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 AP3S2P59780 193 aa-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
SENP6-210ENST00000487548 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.52□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms