RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 REG1BP48304 166 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZADH2Q8N4Q0 377 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 A1L4Q6 167 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 G3V4G9 280 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 J3QW42 95 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 IGHG3P01860 377 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CSN1S1P47710 185 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FAM27E3Q08E93 113 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MOSP00540 346 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ITLN1Q8WWA0 313 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PET117Q6UWS5 81 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PRNTQ86SH4 94 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SEC11AP67812 179 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SEM1Q6ZVN7 128 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 hADV38S2A0JD32 116 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf118A6NHY6 69 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NCR2O95944 276 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C18orf15Q96N68 181 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CACNG7P62955 275 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RBPJQ06330 500 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS46E5RG02 174 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SIGMAR1Q99720 223 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 COX8AP10176 69 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 VSTM2AQ8TAG5 236 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF14Q92956 283 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GCSAMQ8N6F7 178 aa13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ERHP84090 104 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 K7EP34 96 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TMPRSS3P57727 454 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CCL8P80075 99 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf54Q6UWD8 224 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TACC2O95359 2948 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM23BQ5SRD1 257 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MED13LQ71F56 2210 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA1BQ00975 2339 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PPIAL4EA0A075B759 164 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1-16P04430 117 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PPIAL4FP0DN26 164 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF329Q86UD4 541 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MBD6Q96DN6 1003 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GPR82Q96P67 336 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CCL13Q99616 98 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GV72 72 aa13.08□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 K7ERJ3 54 aa13.08□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.08□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PIP4P1Q86T03 277 aa13.08□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.08□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 IFI27L2Q9H2X8 130 aa13.08□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ATRXP46100 2492 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM120AOSQ5T036 256 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 HCP5Q6MZN7 132 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 RASL11AQ6T310 242 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 GTSF1Q8WW33 167 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 EPDR1Q9UM22 224 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A15Q9Y619 301 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 OR2J3O76001 311 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PCP2Q8IVA1 136 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PRNDQ9UKY0 176 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 DSCAMO60469 2012 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PSG3Q16557 428 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CALYQ9NYX4 217 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 IGF2RP11717 2491 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM87AP0C7U9 286 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 BMI1P35226 326 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS7P47929 136 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.6 ms