RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 GP9P14770 177 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ORM2P19652 201 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TAS2R45P59539 299 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 BTN1A1Q13410 526 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 Q8N2B8 174 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 FAM223BA6NKX1 122 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 H3BRN7 92 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 AP4M1O00189 453 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 GNG7O60262 68 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-23P01764 117 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 FABP1P07148 127 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 PYYP10082 97 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2G2P60604 165 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C1QL4Q86Z23 238 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR4F5Q8NH21 305 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 RNF125Q96EQ8 232 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR4F4Q96R69 305 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 KLK15Q9H2R5 256 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR51M1Q9H341 326 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 VPS13CQ709C8 3753 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 GGTLC3B5MD39 225 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 F6UZH7 168 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 PDE6DO43924 150 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 CLEC3BP05452 202 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 OR10J4P0C629 311 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 Q56UQ5 140 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 AWAT1Q58HT5 328 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM86BQ8N661 226 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TEX29Q8N6K0 151 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 Q8WTZ3 238 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 C17orf77Q96MU5 243 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 YPEL4Q96NS1 127 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 MS4A10Q96PG2 267 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 JMJD8Q96S16 334 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 PAXXQ9BUH6 204 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 PARLQ9H300 379 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF702PQ9H963 129 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM89A2RUT3 159 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 OR2T8A6NH00 312 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 OR7C2O60412 319 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 IGHG4P01861 327 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 IGLC2P0DOY2 106 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 MED14OSP0DP75 135 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 LYZP61626 148 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 ATP5G2Q06055 141 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 RHEBQ15382 184 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TVP23CQ96ET8 276 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 USMG5Q96IX5 58 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TUBA4BQ9H853 241 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 ITPR3Q14573 2671 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 A0A087WWC5 75 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF98A6NK75 572 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF727A8MUV8 499 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TGOLN2O43493 480 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 NDUFB4O95168 129 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TRGV3P03979 118 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 IL4P05112 153 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 PSMB8P28062 276 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 GPR183P32249 361 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms