RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466073.5

TFAP2A-208, Transcript of transcription factor AP-2 alpha, human

TSL 1 (best)

Gene TFAP2A, Length 987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFAP2A-208	ENST00000466073	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TFAP2A-208	ENST00000466073	CENPX	A8MT69	81 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SYNGR2	O43760	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF90	Q03938	601 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	HERC2	O95714	4834 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	WRB	O00258	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	NEU1	Q99519	415 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	NDUFB6	O95139	128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	IFNA21	P01568	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073		P0DMU3	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	TRGV9	Q99603	122 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ISLR	O14498	428 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SOCS3	O14543	225 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	S100A7	P31151	101 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	MEOX2	P50222	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	AKR1C1	Q04828	323 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	OR2F1	Q13607	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	GALR1	P47211	349 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	BAK1	Q16611	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	THAP8	Q8NA92	274 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073		H3BP45	60 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	OR4E1	P0C645	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	EMP1	P54849	157 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	PAX9	P55771	341 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	FXYD7	P58549	80 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	DEFB1	P60022	68 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TFAP2A-208	ENST00000466073	SMCO3	A2RU48	225 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	ADAP1	O75689	374 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	PSG9	Q00887	426 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	SSSCA1	O60232	199 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	HBE1	P02100	147 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073		A0A0J9YX75	114 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	IL7	P13232	177 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	ORM2	P19652	201 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	ID3	Q02535	119 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	GPR82	Q96P67	336 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TFAP2A-208	ENST00000466073	DOK5	Q9P104	306 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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